MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyperthermus butylicus DSM 5456 chromosome

Total Repeats: 6547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008818	CTG	2	6	1	6	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008818	GCC	2	6	33	38	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008818	AGG	2	6	199	204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008818	GGC	2	6	230	235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008818	TAC	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008818	CTT	2	6	337	342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008818	CT	3	6	397	402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008818	CTACC	2	10	422	431	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_008818	GCG	2	6	492	497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008818	AAT	2	6	517	522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008818	CT	3	6	622	627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008818	AGG	2	6	653	658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008818	AGG	2	6	669	674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008818	GCCC	2	8	710	717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_008818	GCC	3	9	753	761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008818	CTA	2	6	790	795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008818	TAT	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008818	TTA	2	6	884	889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008818	GTCC	2	8	1858	1865	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008818	CACC	2	8	1868	1875	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_008818	CA	3	6	1887	1892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008818	GAC	2	6	1898	1903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008818	ATA	2	6	1907	1912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008818	GCA	2	6	1934	1939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008818	CA	3	6	1945	1950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008818	GCC	2	6	2005	2010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_008818	TGC	2	6	2107	2112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008818	CCT	2	6	2134	2139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008818	CAG	2	6	2146	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008818	GAG	2	6	2173	2178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008818	TA	3	6	2179	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008818	CA	4	8	2242	2249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008818	AC	3	6	2277	2282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008818	AAC	2	6	2299	2304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008818	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008818	CAC	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008818	G	6	6	2371	2376	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008818	TGG	2	6	2377	2382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008818	CCGG	2	8	2384	2391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008818	CCCA	2	8	2451	2458	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_008818	CAT	2	6	2487	2492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008818	GCC	2	6	2541	2546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008818	TC	3	6	2599	2604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008818	CAGA	2	8	2638	2645	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008818	GCC	2	6	2698	2703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_008818	GCC	2	6	2781	2786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008818	CGG	3	9	2843	2851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008818	TCC	2	6	2922	2927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008818	GAG	2	6	2938	2943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008818	GGA	2	6	3077	3082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008818	GGC	2	6	3089	3094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008818	GGGT	2	8	3139	3146	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008818	GGC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008818	GC	3	6	3181	3186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008818	CG	3	6	3197	3202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008818	GC	3	6	3207	3212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008818	CGC	2	6	3271	3276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008818	GTG	2	6	3335	3340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008818	GCG	2	6	3341	3346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008818	TCA	2	6	4786	4791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008818	C	6	6	5015	5020	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_008818	TAGC	2	8	5037	5044	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008818	CCT	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008818	ACT	2	6	5067	5072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008818	AAT	2	6	5325	5330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008818	ATGT	2	8	5361	5368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008818	G	6	6	5411	5416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008818	TGC	2	6	5465	5470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008818	TGG	2	6	5501	5506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008818	GTT	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008818	TGC	2	6	6886	6891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008818	GGT	2	6	7179	7184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008818	TAGA	2	8	7201	7208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008818	TCC	2	6	7224	7229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008818	TGAC	2	8	7242	7249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008818	TTGG	2	8	7892	7899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008818	G	6	6	7903	7908	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008818	GCCC	2	8	7950	7957	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_008818	ATT	2	6	8014	8019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008818	TGG	2	6	8021	8026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008818	CCA	2	6	10616	10621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_008818	TGG	2	6	10636	10641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008818	TG	3	6	10701	10706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008818	TA	3	6	10754	10759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008818	TG	3	6	10778	10783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008818	TG	3	6	11555	11560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008818	CGC	2	6	11579	11584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008818	GAG	2	6	11595	11600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008818	GAA	2	6	11639	11644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008818	CTC	2	6	11686	11691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008818	CCT	2	6	11697	11702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008818	ACA	2	6	11761	11766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008818	TAC	2	6	11781	11786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008818	CTC	2	6	11850	11855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008818	GTG	2	6	14008	14013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008818	ATT	2	6	14015	14020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008818	GA	3	6	14037	14042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008818	TGA	2	6	14857	14862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008818	CT	3	6	14884	14889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008818	TAG	2	6	16037	16042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008818	GCT	2	6	16108	16113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008818	GCT	2	6	16144	16149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008818	TGC	2	6	16190	16195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008818	ATGT	2	8	16227	16234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008818	CTCG	2	8	16242	16249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008818	CT	3	6	16255	16260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008818	CTAC	2	8	17603	17610	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008818	TA	3	6	18642	18647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008818	AGT	2	6	18659	18664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008818	TGGT	2	8	18681	18688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008818	GCTAG	2	10	20042	20051	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_008818	CAG	2	6	21471	21476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008818	ATC	2	6	21488	21493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008818	TTC	2	6	21517	21522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008818	TGGAA	2	10	22392	22401	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008818	AGG	2	6	22447	22452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008818	GGCT	2	8	24556	24563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008818	ACT	2	6	26010	26015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_008818	AGG	2	6	27411	27416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008818	CATC	2	8	27471	27478	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008818	CGT	2	6	27493	27498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008818	CAT	2	6	27503	27508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008818	AC	3	6	32509	32514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008818	AGC	2	6	32547	32552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008818	CTTC	2	8	34165	34172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008818	GA	3	6	35926	35931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008818	TC	3	6	35962	35967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008818	CTA	2	6	37249	37254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008818	GTA	2	6	37329	37334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008818	AG	3	6	37336	37341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008818	ACC	2	6	39400	39405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008818	CTA	2	6	39453	39458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008818	CTGA	2	8	39468	39475	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008818	AT	3	6	39485	39490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008818	TGC	2	6	39525	39530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008818	GAG	2	6	39534	39539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008818	AG	3	6	39574	39579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008818	AT	3	6	41884	41889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008818	TAG	2	6	41944	41949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008818	GGT	2	6	43098	43103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008818	G	6	6	43138	43143	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008818	GGTA	2	8	43185	43192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008818	TAG	2	6	43515	43520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008818	AGT	2	6	43521	43526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008818	GCA	2	6	43536	43541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008818	TGG	3	9	43597	43605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008818	CAATG	2	10	43637	43646	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_008818	CTA	2	6	43739	43744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008818	C	6	6	43786	43791	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
150	NC_008818	TGGG	2	8	43807	43814	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008818	ACT	2	6	44784	44789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_008818	CTC	2	6	44816	44821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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154	NC_008818	TAA	2	6	47960	47965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008818	TGA	2	6	47995	48000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_008818	TA	3	6	48092	48097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008818	GTG	2	6	48118	48123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008818	GGA	2	6	48220	48225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008818	GCC	2	6	48234	48239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_008818	ACC	2	6	48259	48264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_008818	CGG	2	6	48298	48303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_008818	TAC	2	6	50830	50835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_008818	AAG	2	6	51536	51541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_008818	CTG	2	6	51570	51575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_008818	AG	3	6	53856	53861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_008818	GCA	2	6	55038	55043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_008818	TAA	2	6	58553	58558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_008818	ATT	2	6	58595	58600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_008818	GA	3	6	60080	60085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_008818	G	7	7	60260	60266	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_008818	GTG	2	6	64591	64596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_008818	TA	3	6	66681	66686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_008818	CGG	2	6	73121	73126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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280	NC_008818	CAC	2	6	76532	76537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_008818	TAC	2	6	76952	76957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_008818	G	6	6	77000	77005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
285	NC_008818	GAG	2	6	77018	77023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
286	NC_008818	AAG	2	6	77050	77055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_008818	CTAG	2	8	77101	77108	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
288	NC_008818	AGG	2	6	77584	77589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
289	NC_008818	GCCGGG	2	12	77601	77612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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